98からバージョンアップしたマシンのセットアップをします。ハードディスクが9.4ＧＢしかないのに前のオペレーティングシステムのバックアップファイルや前のオペレーティングシステムのバックアップファイルが残っていてディスクを半分ほど使用しています。前のシステムに戻す予定はありません。削除してしまって問題ないでしょうか？

以前の状態に戻すつもりがないのならば

まったく問題ありません。

フォーマットしてしまった方が良いでしょう。

これからインストールするOSによって

選択したいファイルシステムも違うでしょうから

フォーマットの仕方が違ってきますので

それぞれのやり方に従ってください。

直接フォルダを削除するのはよろしくありません。再インストールのウィザードに従ってフォーマットを行ってください。

Windows98インストールCD-ROMあるいはプロダクトリカバリCD-ROMやドライバーディスクなどの付属品一式をお持ちであれば、消してしまっても問題は無いです（今のOSがトラぶった時に必要になる場合があるので、98に戻す気が無くても捨ててはいけません）

空き容量を増やしたいのであれば、まずは、外付けハードディスクなどにマイドキュメントの中身を移動させるほうが、トラブル発生時にデータが消えたといった事が無くて良いです。

本当に大事なデータは外付けハードディスクとCD-Rなどの記録メディアに平行して保存しておけば片方が潰れても・・・